Фактори кои ја одредуваат ефикасноста на синтезата на ДНК

Во типичната синтеза на ДНК, РНК и неприродни нуклеински киселини, чекорот на дезаштита и спојување игра клучна улога.

Чекорот на дезаштита е да се отстрани DMT групата на цврстата поддршка или 5' хидроксилната група на претходниот нуклеозид со органска киселина и да се изложи хидроксилната група за следниот чекор на спојување.3% трихлороцетна киселина во дихлорометан или толуен најчесто се користи за спроведување на чекорот на дезаштита.Концентрацијата на трихлороцетна киселина и времето на дезаштита (време на деблокирање) доминираат во чистотата на финалните производи.Ниската концентрација и недоволното време на деблокирање оставаат нереагирани DMT групата, кои го намалуваат приносот и ги зголемуваат несаканите нечистотии.Долготрајното време на деблокирање може да доведе до депулар на синтетизирани секвенци, формирајќи ги неочекуваните нечистотии.

Чекорот на спојување е чувствителен на содржината на вода во растворувачите и влагата во воздухот.Концентрацијата на вода во синтезата треба да биде помала од 40 ppm, подобро помала од 25 ppm.За да се одржи состојбата на безводна синтеза, синтезата на нуклеинските киселини треба да се изврши во средина со ниска влажност, затоа им препорачуваме на нашите клиенти да го користатРастворена опрема со амидити, што може да го раствори прав или мрсен фосфорамидит во безводен ацетонитрил за да избегне контакт со воздухот.

Факторите кои ја одредуваат ефикасноста на синтезата на ДНК5
Факторите кои ја одредуваат ефикасноста на синтезата на ДНК4

Бидејќи растворањето на фосфорамидитите е подобро во ситуација без вода, и молекуларните стапици за адсорпција на трагите на водата во реагенсите и амидитот, потребно е да се подготвиМолекуларни стапици.Препорачуваме 2 g subsieve за шишиња со реагенси од 50-250 ml, 5 g за шишиња со реагенси од 250-500 ml, 10 g за шишиња со реагенси од 500-1000 ml и 20 g за шишиња со реагенс од 1000-2000 ml.

Распуштањето на фосфорамидите треба да се изврши под инертна атмосфера, а замената на активаторските реагенси и ацетонитрилот треба да се заврши навреме.Реагенсите за покривање и оксидација треба да се користат што е можно поскоро, отворените реагенси даваат помал рок на траење и помала активност за време на синтезата.


Време на објавување: август-09-2022 година